人工智能企業(yè)天壤公司日前宣布，其自研的深度學習蛋白質折疊預測平臺TRFold在基于CASP14(2020年第14屆國際蛋白質結構預測競賽)蛋白質測試集的評估中排名全球第二，僅次于AlphaFold2。在400個氨基酸的蛋白鏈預測時，TRFold僅耗時16秒。據了解，這是目前國內所有公開蛋白質結構預測模型中取得的最好成績，標志著我國計算生物學領域的表現已經處于世界第一梯隊。
“我們通過兩年半的時間掌握了蛋白質折疊核心技術，并以此參與到國際最前沿的生物醫(yī)學領域的應用中，希望能夠開辟出一條AI生物學的應用之路。”天壤公司創(chuàng)始人薛貴榮介紹，公司研發(fā)團隊在兩年半前開始進入計算生物學領域，天壤非?？春萌斯ぶ悄茉谏镱I域的應用，尤其是AlphaFold2解決了單體蛋白質解構預測的問題，令天壤覺得人工智能會成為生物研發(fā)的基礎設施，將開啟一個廣闊和巨大的市場，隨著技術突破將重構許多原來的生物應用層面的邏輯，比如制藥的流程、疾病的治療、個性化醫(yī)療等等。
據了解，天壤是提供通用人工智能的公司，主要應用在城市和企業(yè)數字化領域。從圍棋到交通，再到如今的計算生物學領域，天壤的人工智能自研技術已具備很強的復雜系統(tǒng)的智能決策能力，旗下AI(人工智能)圍棋TRGo、AI交通TRTraffic等技術都夯實了天壤的深度強化學習平臺。
“與之前相比，蛋白質結構預測是更復雜的領域，天壤本身的技術積累很適合解鎖此類場景，所以進入這個領域是非常自然的選擇。” 薛貴榮認為，不僅如此，這將為生命科學和醫(yī)藥領域帶來益處，極大增進人類對細胞基本構成的理解，讓藥物研發(fā)加速升級，并將帶來醫(yī)療保健、食品可持續(xù)性、新技術等方面的改善，進一步促進生物科學、藥物研發(fā)、合成生物學方面的發(fā)展。
“我們長期以來面臨的都是此類復雜系統(tǒng)的決策問題，在技術層面已經有了深厚的積累。蛋白質折疊預測雖然是生物學課題，但也屬于這個領域，并且體現了AI在基礎科學中的巨大潛能，這也是每個立志于基礎研發(fā)的AI從業(yè)者的價值取向，我們不愿意錯過這道風景。”薛貴榮說。
據天壤XLab研發(fā)團隊負責人苗洪江介紹，目前，天壤蛋白質預測模型算法還在迭代優(yōu)化。為了獲得更佳的性能，TRFold在內存、訓練數據、模型表達等方面做了許多創(chuàng)新和優(yōu)化。目前的單個蛋白質折疊預測只是一個起點，接下來的工作重點將是利用目前的全蛋白質組協(xié)同進化分析，建立起蛋白質與蛋白質之間的相互作用的精準鏈路。
經濟日報新聞客戶端
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